De werkzaamheden aan de tweede generatie Fiat Ducato begonnen al in 1987. Giorgetto Giugiaro van Ital Design was verantwoordelijk voor het carrosserieontwerp. De nieuwe Ducato zou een doorbraak betekenen op het gebied van aerodynamica van bedrijfsvoertuigen, dankzij de optimale (op dat moment) vermindering van de luchtweerstand. De gestroomlijnde voorkant van de tweede generatie Ducato droeg bij aan het resultaat van Cx = 0,35, wat op dat moment het beste resultaat was onder Europese bestelwagens. De oude stijl werd volledig verlaten, na verloop van tijd. De interne, werkende naamgeving van het nieuwe voertuig was de term Type 230.
De tweede generatie Ducato werd in maart 1994 voor het eerst gepresenteerd op de beurs van Genève. Een jaar later behaalde het Italiaanse busje de eerste plaats in de prestigieuze Van Of The Year-competitie. Sommige ontwerpoplossingen die in de vorige generatie hebben gewerkt, zijn gehandhaafd. Ze besloten om voorwielaandrijving te gebruiken en de motor dwars te plaatsen. De voorwielophanging is gebaseerd op McPhersons, terwijl de achterkant een stijve as op paraboolveren heeft. De focus lag echter op het creëren van vele variaties van het lichaam met verschillende lengtes, hoogtes en enkele soorten wielbasissen. In plaats van Fiat Tolento te ontwikkelen, werd eenvoudigweg besloten om een kleinere, compactere versie van de Ducato II te maken met een lengte van 4521-5681 mm en een wielbasis van 2850-3700 mm. De Fiat Ducato II was moderner, aerodynamischer en aangepast aan de behoeften van de meest uiteenlopende klanten. De meest voorkomende waren versies met 1.9D-dieselmotoren. In het begin was er slechts één versie van de 109 PK benzinemotor beschikbaar. In september 2000 begon de productie van Fiat Ducato II in Sete Lagoas, Brazilië.
In 2002 werd Fiat Ducato gemoderniseerd. Naast de carrosserie-facelift zijn ook het interieur van het voertuig en het beschikbare motorengamma gewijzigd. Het was ook de eerste Ducato-versie met een 4x4-aandrijving in de fabrieksversie. Daarnaast is het assortiment benzinemotoren ontwikkeld. Het waren nog steeds twee-liter units, maar versies aangedreven door CNG (97 HP) en LPG (109 HP) werden geïntroduceerd. De interne aanduiding van de vernieuwde bestelwagen was Type 244. De veranderingen waren zo groot dat veel mensen de vernieuwde versie als een volledig nieuwe generatie Fiat's bestelwagens beschouwden. De belangrijkste elementen van het voertuig, zoals het onderstel, kwamen van het type 230. Maar deze wijzigingen worden alleen als facelift beschouwd. Alle dieselunits die de Ducato II aandreven, waren uitgerust met Common Rail-injectie. Dit heeft invloed op het niveau van verbrandingsreductie en het vergroten van het vermogen van de motor. De sterkste eenheid genereerde 146 HP. Op 15 december 2005 kondigde het bedrijf aan dat de 3 miljoenste Fiat Ducato werd geproduceerd. Dit resultaat heeft bijgedragen aan de toename van de productie tot 9 voertuigen per dag. Het is vermeldenswaard dat de post-facelifting-versie van Ducato II in Brazilië zo populair was dat het tot 2018 werd geproduceerd. Dit was mogelijk omdat er geen emissiebeperkingen waren in Zuid-Amerika.