Peugeot Boxer II werd voor het eerst gepresenteerd in 2006. In hetzelfde jaar begon de massaproductie in Italië en Mexico. De nieuwe Peugeot-bus heeft een nog meer gestroomlijnde vorm gekregen, waardoor het mogelijk was om de luchtweerstandscoëfficiënt met nog een paar procent te verlagen (Cx = 0,31). Peugeot Boxer II zou het laadvermogen en de veelzijdigheid van het busje combineren met het comfort van een personenauto. Zo werd het assortiment beschikbare carrosserieversies uitgebreid en werden enkele voorzieningen geïntroduceerd in de bestuurderscabine.
De tweede generatie Peugeot Boxer bracht stijlwijzigingen met zich mee. De motorkap is duidelijk gescheiden van de bumper, waardoor een onderscheidende drempel ontstaat. De eigenaren en liefhebbers van dit model merkten treffend op dat het busje de indruk geeft van buigspieren. Het hart van de bumper was een plastic rooster. Boxer II heeft zijspiegels met ingebouwd indicatielampje. De fabrikant bood ze ook aan in versies met een buitentemperatuursensor in een van de spiegels. Aan de achterzijde van het voertuig waren nieuwe, modernere achterlichten. De vrachtversie had nog meer laadruimte en bood 6 varianten van 8 tot 17 m3, en de laadcapaciteit (4 versies) varieerde van 1 tot 2 ton. Onder de passagiersversie was naast de stationwagon met 8 passagiers ook een minibus voor 15 passagiers beschikbaar.
De Franse autofabrikant gaf volledig benzinemotoren op. Uit de uitgevoerde analyses bleek dat benzine-eenheden in bestelwagens meerdere malen minder populair zijn dan dieselmotoren. Daarom is de Europese versie van het voertuig tot op heden alleen te koop met oliemotoren. In de tweede generatie Boxer waren er twee soorten handgeschakelde versnellingsbakken - 5 versnellingen en 6 versnellingen, die vermogen rechtstreeks op de vooras overbrachten.
In de Peugeot Boxer II waren weinig aanpassingen die het zo vergelijkbaar mogelijk zouden maken aan een personenauto. Natuurlijk heeft de fabrikant niet vergeten om een paar zakken en opbergvakken toe te voegen, die het ruimtepotentieel van het busje vergrootten. De nieuwe versie is zo ontworpen dat extra apparatuur kan worden geïnstalleerd: automatische airconditioning, een audiosysteem met een handsfree kit of GPS-satellietnavigatie. In de loop der jaren en de ontwikkeling van technologie, zijn de daaropvolgende oplossingen die in personenauto's worden gebruikt, geleidelijk geïmplementeerd in bestelauto's.
In 2014, 8 jaar na de première, is het tijd voor facelift Peugeot Boxer II. Voor sommige mensen zijn de veranderingen zo groot dat ze deze versie de derde generatie van het busje noemen. Dit is echter geen professionele naamgeving, omdat de fabrikant duidelijk aangaf dat het slechts een facelift was. De belangrijkste verandering was de verbouwing van de voorkant, die paste in de heersende stijl van de modellen van het Franse merk. Het was het ontwerp dat mensen moest overtuigen die geïnteresseerd zijn in het kopen van een busje. Verdere wijzigingen betroffen configuratie-opties. De achterkant van het voertuig is met 7 centimeter verlaagd dankzij het gebruik van pneumatische vering. De grootste van de aangeboden modellen heeft een totaal gewicht van 4 ton, terwijl de versie voor het vervoeren van mensen 8 zitplaatsen biedt. Onder de motorkap zaten opnieuw 2 dieselunits met dezelfde capaciteiten tot nu toe. Deze keer was de kleinere motor echter beschikbaar in drie vermogensvarianten - 110, 130 of 150 PK. De grotere eenheid genereert 180 pk. De gerenoveerde versie introduceert nieuwe koplampen met led-dagrijverlichting. Voor optimaal comfort voor bestuurders en passagiers zijn de stoelen vervangen door een volledig nieuwe generatie. De functionele veranderingen omvatten ook een bekerhouder geïntegreerd met de console en een houder voor mobiele apparaten en notebooks.